Ang isyu ng mga bagong pasaporte para sa mga mamamayan ng East African Community pansamantalang nasuspinde upang payagan ang mga bagong tampok na state-of-the-art na isama sa susunod na edisyon. Sa kasalukuyan, ang mga pasaporte ay hindi nababasa ng makina o nagdadala ng data ng biometric sa ipinasok na mga computer chip, at upang gawing mas katanggap-tanggap ang mga ito, ang mga bagong karagdagan ay dapat munang ayusin.
Ang mga pasaporte ay tanyag sa Uganda at Kenya, kung saan kailangan lamang ng mga manlalakbay na naka-stamp nang isang beses sa bawat anim na buwan kung lumipat sa mga hangganan ng bansa sa isa sa mga estado ng miyembro ng EAC, ngunit may mga paratang din na lumabas na ang mga opisyal ng imigrasyon sa mga hangganan ng lupa at paliparan. binalewala lamang ang mga patakarang ito at patuloy na itinatak ang mga ito tulad ng pambansang pasaporte. Ang Burundi at Rwanda ay, matapos na sumali sa EAC noong nakaraang taon, ay hindi pa naipatupad ang isyu ng mga dokumento sa paglalakbay na ito.
Ang mga pasaporte ng EAC ay hindi rin karaniwang tinatanggap sa kabila ng rehiyon, na mayroong maraming mga regular na manlalakbay na nagdadala ng parehong mga pambansa at EAC na pasaporte, isang sitwasyon na isinulat din ng kalihim ng Komunidad ng East Africa sa Arusha na tutugon sa oras para sa pagsisimula ng pag-isyu ng susunod na henerasyon ng mga pasaporte ng EAC . Samantala, ang mga mamamayan ng limang miyembro ng estado ay gagamit ng kanilang sariling pambansang pasaporte para sa paglalakbay sa buong rehiyon.
