Ang CDC ay naglunsad ng isang kasunduan sa pambansang viral genomics

Ang US Centers for Disease Control and Prevention, CDC, ay naglunsad ng isang kasunduan upang simulan ang isang pambansang network ng mga pagkakasunud-sunod ng mga laboratoryo na magpapabilis sa paglabas ng data ng pagkakasunud-sunod ng SARS-CoV-2 sa pampublikong domain. Mabilis na paglabas ng bukas na data ng pagkakasunud-sunod ng coronavirus ay makakatulong sa gabay Covid-19 tugon sa kalusugan ng publiko, humimok ng pagbabago at pagtuklas, at isulong ang pag-unawa sa mga ito at sa hinaharap na pandemics.

ito Ang pagkakasunud-sunod ng SARS-CoV-2 para sa Public Health Emergency Response, Epidemiology and Surveillance (SPHERES) kasunduan, na kung saan ay lubos na mapalawak ang paggamit ng buong genome sequencing (WGS) ng COVID-19 na virus. Magbibigay ang SPHERES ng pare-pareho, real-time na pagkakasunud-sunod ng data sa mga pangkat ng pagtugon sa kalusugan ng publiko na iniimbestigahan ang mga kaso at kumpol ng COVID-19 sa buong bansa.

Ang bagong kasunduan na ito ay makakatulong sa kanila na mas maunawaan kung paano kumakalat ang virus, kapwa pambansa at sa kanilang mga lokal na pamayanan. Ang mas mahusay na data, sa turn, ay makakatulong sa mga opisyal ng kalusugan ng publiko na magambala ang mga tanikala ng paghahatid, maiwasan ang mga bagong kaso ng karamdaman, at maprotektahan at mai-save ang buhay.

"Ang US ang nangunguna sa buong mundo sa advanced na mabilis na pagkakasunud-sunod ng genome. Ang pinag-ugnay na pagsisikap sa kabuuan ng aming publiko, pribado, klinikal, at pang-akademikong publikong mga laboratoryo sa kalusugan ay maglalaro ng mahalagang papel sa pag-unawa sa paghahatid, ebolusyon, at paggamot ng SARS-CoV-2. Tiwala ako na ang aming pinakamagaling, pinakamagaling na mga kaisipan ay nagtutulungan upang matulungan kaming makatipid ng buhay ngayon at bukas, "sabi ng CDC Director na si Robert Redfield, MD

Pagsubaybay sa virus ng COVID-19 habang umuusbong ito

Ang data ng pagkakasunud-sunod ng genomic ay maaaring magbigay ng walang uliran pananaw sa biology ng SARS-CoV-2, ang virus na sanhi ng COVID-19, at makakatulong na tukuyin ang nagbabago na tanawin ng pandemya. Sa pamamagitan ng pagkakasunud-sunod ng mga virus mula sa buong Estados Unidos, ang CDC at iba pang mga awtoridad sa kalusugan ng publiko ay maaaring subaybayan ang mahahalagang pagbabago sa virus at gamitin ang impormasyong ito upang gabayan ang pagsubaybay sa pakikipag-ugnay, mga pagsisikap sa pagpapagaan ng kalusugan ng publiko, at mga diskarte sa pagkontrol sa impeksyon.

Ang consortium ng SPHERES ay isang ambisyosong pagsisikap upang maiugnay ang pagkasunud-sunod ng genome ng SARS-CoV-2 sa buong bansa, na nag-oorganisa ng dose-dosenang mas maliit, indibidwal na mga pagsisikap sa isang solong, ipinamahaging network ng mga laboratoryo, institusyon at korporasyon. Pinagsasama ng consortium ang kadalubhasaan, teknolohiya, at mapagkukunan ng 40 estado at lokal na mga kagawaran ng kalusugan ng publiko, maraming malalaking mga laboratoryo sa klinikal, at higit sa dalawampung dosenang mga nagtutulungan na institusyon sa pederal na gobyerno, akademya, at pribadong sektor.

Ang SPHERES ay magtataguyod ng mga pinakamahuhusay na kasanayan at pamantayan ng data ng pinagkasunduan, mapabilis ang bukas na pagbabahagi ng data, at magtatag ng isang pool ng mga mapagkukunan at kadalubhasaan upang matulungan na dalhin ang pinakamababang teknolohiya sa pambansang sagot ng COVID-19.

Ang data ng SPHERES ay bukas, ibinahagi

Ang mga miyembro ng Consortium ay nagbabahagi ng isang pangako sa mabilis na bukas na pagbabahagi ng pagkakasunud-sunod. Plano nilang isumite ang lahat ng kapaki-pakinabang na data ng pagkakasunud-sunod sa mga pampublikong repositoryo sa National Library of Medicine's National Center for Biotechnology Information (NLM / NCBI), ang Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID), at iba pang mga pampublikong repository ng pagkakasunud-sunod. Makatutulong ito na matiyak na ang data ng pagkakasunud-sunod ng viral mula sa buong Estados Unidos ay mabilis na magagamit para sa paggawa ng desisyon sa kalusugan ng publiko at malayang ma-access sa mga mananaliksik saan man.

Kasama sa mga miyembro ng Consortium ang:

Mga ahensya ng pederal at mga laboratoryo

Mga Sentro para sa Pagkontrol at Pag-iwas sa Sakit, Opisina ng Advanced na Pagtuklas ng Molekular

Argonne National Laboratory

Ahensya ng Depensa sa Kalusugan, Pandaigdigang Nakakahawa Sakit Surveillance

Pagkain at Drug Administration

Lawrence Berkeley National Laboratory

Los Alamos Pambansang Laboratory

Pambansang Institute of Allergy at Mga Nakakahawang Sakit, Opisina ng Genomics at Advanced Technology

National Institute of Pamantayan at Teknolohiya

National Library of Medicine's National Center para sa Impormasyon sa Biotechnology

Walter Reed Army Institute of Research

Mga laboratoryo ng kalusugan ng estado / lokal

Arizona

California

Delaware

Distrito ng Columbia

Plorida

Hawaii

Maine

Maryland

Massachusetts

Michigan

Minnesota

North Carolina

North Dakota

Nevada

New Mexico

New York

Utah

Virginia

Washington

Wisconsin

Wyoming

Mga Institusyong Pang-akademiko

Baylor University

Cornell University

Fred Hutchinson Cancer Center ng Pananaliksik

Mount Sinai School of Medicine

New York University

Northern Arizona University

University of Buffalo

University of California, Berkeley

University of California, Davis

University of California, Irvine

University of California, Los Angeles

University of California, San Francisco

University of California, Santa Cruz

University of Chicago

University of Maryland

University of Minnesota

University of Nebraska

University of New Mexico

University of Washington

unibersidad ng Yale

Mga korporasyon

Diagnostics ng Abbott

bioMerieux

Mga Kulay ng Genomics

Gingko Bioworks

IDbyDNA

In-Q-Tel

LabCorp

Isang Codex

Mga Teknolohiya ng Oxford Nanopore

Mga Bioscience sa Pasipiko

Qiagen

Mga Diagnostics ng Quest

Katotohanang Mga Agham sa Buhay

Ang mga pangalan ng mga korporasyon ay ibinibigay para sa mga layunin ng impormasyon lamang, at ang kanilang pagsasama dito ay hindi bumubuo ng isang pag-eendorso ng mga korporasyon o alinman sa kanilang mga komersyal na produkto o serbisyo ng US Centers for Disease Control and Prevention.

Mga institusyong pangkalusugan o pananaliksik sa publiko na hindi kumikita

Association of Public Health Laboratories

Bill at Melinda Gates Foundation

Malawak na Institute

Chan Zuckerberg BioHub

Craig Venter Institute

Public Health Alliance para sa Genomic Epidemiology

Pananaliksik sa Scripps

Ang Jackson Laboratory

Translational Genomics Research Institute - Hilaga

Walder Foundation

Sa nagdaang anim na taon, ang CDC's Office of Advanced Molecular Detection program ay namuhunan sa federal at state public health laboratories upang palawakin ang paggamit ng pathogen genomics at iba pang advanced na mga teknolohiya sa laboratoryo para sa nakakahawang pagsubaybay sa sakit at pagtugon sa pagsiklab. Nilalayon ng kasalukuyang pamumuhunan ng kasunduan upang mai-save ang buhay sa pandemya ng SARS-CoV-2 at ihanda ang Estados Unidos at ang mundo para sa tugon sa pandemi sa hinaharap.

Upang matuto nang higit pa tungkol sa pagkakasunud-sunod ng genomic o gawain ng CDC sa advanced na pagtuklas ng molekular, bisitahin https://www.cdc.gov/amd/